Mudanças podem causar receio e desconforto para quem não está preparado. Por isso, no João as transições da Educação Infantil para o Ensino Fundamental e da 4ª para a 5ª série contam com um acompanhamento especial. Esta espécie de ritual de passagem tem a participação dos alunos, professores, pais e coordenadores. Os alunos se mostram tranquilos, pois, acolhidos pela nova equipe, sentem-se "em casa novamente".

Na 4ª série, as professoras preparam os alunos iniciando a aplicação de provas e trabalhos com nota. Mostram a importância e a frequência do uso da agenda escolar nas próximas séries, e os professores de 5ª série são apresentados.

Esta preocupação vem desde a Educação Infantil, quando, por meio de atividades lúdicas, educadores e professores iniciam um trabalho de preparação, com foco na alfabetização e na transição para o 1º ano do EF.